本方向围绕我国植物学研究近期发展的战略目标，依托我省农业、资源和生态的三大优势，结合自身科研工作基础，主要开展基础和应用基础研究。（1）系统与进化植物学研究。主要研究苔藓植物的相互关系和进化趋势研究、苔藓植物组织培养的研究、苔藓植物遗传多样性的研究、苔藓植物逆境生理学研究；本方向在苔藓植物染色体研究和等位酶研究方面已经达到国际先进水平，在国内处于领先地位，有一定的影响。（2）发育与资源植物学研究。主要研究植物细胞分化发育及次生代谢产物形成；大豆分子标记辅助育种；扎龙湿地植物形态发生与生境的关系，种子萌发生理及其与幼苗抗逆性，以及浆果采后生理与贮藏和果汁保鲜技术等。