微生物学作为基础生物学，不仅提供了一些重要的基于物理和化学原理探讨自然生命过程的有关研究材料，而且作为应用科学，微生物学已经涉及医学、药学、工业、农业和环境中的许多实际问题。当今微生物学各个研究领域之间的延伸和相互交叉，微生物学和其他学科的相互交叉，是构成现代微生物学的显著特征。

齐齐哈尔大学设置的微生物学科属于生物学一级学科下的二级学科。微生物学的培养目标为利用微生物学科的理论、研究方法和技术手段，综合进行微生物代谢、微生物生物转化、微生物药物研究领域内关键技术的研究与开发，培养我国微生物学和生物技术方向人才。

目前，已形成具有良好生源基础条件、高水平的师资队伍、明确的研究方向、各层次科研项目充足的资金来源等学科优势。近5年来，共承担科研项目30余项，其中国家重大专项4项、国家自然科学3项，省、市自然科学基金等项目共25项，获得科研经费600余万元，国内外发表学术论文50余篇,其中SCI收载10余篇；出版的代表性专著5部，申请或授权发明专利11项。

微生物学科内拥有一支在年龄、职称、学历等诸方面结构合理的教学科研梯队，现有教师6人，其中教授1人（博士生导师1人）、副教授2人，讲师3人，83%具有博士学位。多人留学美国和英国，科研经验丰富。

微生物学科下设微生物代谢产物开发与制备、环境微生物学和微生物资源开发与利用等科研方向。